问题1："[家族].[040428][VisualArt's][Key][Clannad][mdf-mds]"是CLANNAD普通版，"[080229] [Key] CLANNAD FULL VOICE (要NoDVD ISO+rr3).part1+part2"是Full Voice版，Full Voice版与普通版的区别是它画质、音质都更好，自带语音，比普通版多1张CG，装好就能玩（如果不汉化的话），不需打语音补丁。所以如果玩的话强烈推荐玩Full Voice版，如果要汉化推荐下这个：
http://tora.to/blog/245735.htm。
你所说的补丁有的只适用于普通版的而不能适用于Full Voice版，有的适用于Full Voice版但是汉化不完全。Full Voice对应的完全汉化补丁FTP上没有，如果需要建议到上述链接下载。
Kanon、AIR、CLANNAD、Planetarian都有不止一个版本，各版本之间的差异可以从牡丹林的置顶贴中找到。
Kanon、AIR、CLANNAD的普通版的安装方法比较繁琐，请参阅对应的置顶贴。
问题2：哪个都不是。如果需要全年龄版可在此下载：
http://www.verycd.com/topics/36404/“AIR汉化包”与“Key Fan Club]AIR汉化” 其中有一个（忘了哪个了）解压后有N个文件，那个使用起来极其麻烦而且好像是翻译成繁体中文的；另一个解压后记得好像只有1个可执行文件，汉化推荐用这个。不过AIR的汉化补丁是18X版的，用在全年龄版会出一点问题，解决方法请参见AIR区置顶贴。
问题3：“[990604] Kanon PC-版 (ccd)”是18X普通版，“Kanon全年龄版”是全年龄Standard Edition版，关于普通版和Standard Edition版的区别请参阅牡丹林置顶贴。
总结：
AIR：
http://www.verycd.com/topics/36404/CLANNAD：
http://tora.to/blog/245735.htmKanon：要汉化只能是全年龄普通版，
http://www.verycd.com/topics/50512/关于压缩版与非压缩版的音质通常来说没区别，但对于我等音乐发烧友来说差别巨大乃至到了不可忍受压缩版音质的地步。
LZ如果想收藏的话，请把FTP上的所有“游戏本体”目录和“补丁”目录的文件全部下载下来，再把FTP上没有的但我上面提到的东西下载下来，就很完美了。
